Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Acta1P68134 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Acta1P68134 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Acta1P68134 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Acta1P68134 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms