Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms