Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms