Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Usp46P62069 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp46P62069 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp46P62069 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp46P62069 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp46P62069 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Usp46P62069 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp46P62069 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp46P62069 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp46P62069 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Usp46P62069 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Usp46P62069 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Usp46P62069 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Usp46P62069 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Usp46P62069 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp46P62069 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp46P62069 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp46P62069 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp46P62069 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Usp46P62069 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp46P62069 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp46P62069 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp46P62069 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp46P62069 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp46P62069 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp46P62069 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp46P62069 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp46P62069 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp46P62069 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp46P62069 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp46P62069 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp46P62069 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp46P62069 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp46P62069 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp46P62069 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp46P62069 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp46P62069 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp46P62069 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp46P62069 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp46P62069 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms