Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tdrd6P61407 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tdrd6P61407 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms