Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abce1P61222 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abce1P61222 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abce1P61222 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abce1P61222 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Abce1P61222 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abce1P61222 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abce1P61222 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms