Protein–RNA interactions for Protein: P61092

Siah1a, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1A, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1aP61092 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Siah1aP61092 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Siah1aP61092 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Siah1aP61092 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Siah1aP61092 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Siah1aP61092 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Siah1aP61092 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Siah1aP61092 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Siah1aP61092 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Siah1aP61092 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Siah1aP61092 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Siah1aP61092 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Siah1aP61092 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Siah1aP61092 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah1aP61092 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah1aP61092 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah1aP61092 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah1aP61092 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah1aP61092 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah1aP61092 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah1aP61092 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah1aP61092 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah1aP61092 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah1aP61092 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah1aP61092 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah1aP61092 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah1aP61092 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah1aP61092 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah1aP61092 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah1aP61092 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah1aP61092 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms