Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps5P59438 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps5P59438 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps5P59438 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps5P59438 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps5P59438 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps5P59438 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps5P59438 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms