Protein–RNA interactions for Protein: P59034

Lrrc3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc3P59034 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc3P59034 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc3P59034 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc3P59034 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc3P59034 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc3P59034 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc3P59034 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc3P59034 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc3P59034 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc3P59034 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc3P59034 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc3P59034 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc3P59034 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc3P59034 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc3P59034 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc3P59034 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc3P59034 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc3P59034 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc3P59034 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc3P59034 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc3P59034 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc3P59034 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc3P59034 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc3P59034 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc3P59034 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc3P59034 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc3P59034 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc3P59034 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc3P59034 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc3P59034 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc3P59034 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc3P59034 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc3P59034 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc3P59034 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc3P59034 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Lrrc3P59034 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Lrrc3P59034 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc3P59034 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms