Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms