Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms