Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Setd4P58467 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Setd4P58467 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd4P58467 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd4P58467 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd4P58467 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms