Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Snrpa1P57784 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Snrpa1P57784 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Snrpa1P57784 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpa1P57784 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpa1P57784 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpa1P57784 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpa1P57784 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpa1P57784 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpa1P57784 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpa1P57784 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpa1P57784 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpa1P57784 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpa1P57784 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpa1P57784 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpa1P57784 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpa1P57784 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpa1P57784 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpa1P57784 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpa1P57784 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms