Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtnsP57757 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtnsP57757 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtnsP57757 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtnsP57757 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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CtnsP57757 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtnsP57757 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CtnsP57757 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CtnsP57757 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CtnsP57757 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CtnsP57757 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CtnsP57757 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms