Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn18P56857 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn18P56857 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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