Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmoP56726 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmoP56726 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmoP56726 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SmoP56726 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmoP56726 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmoP56726 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmoP56726 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmoP56726 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmoP56726 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SmoP56726 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SmoP56726 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmoP56726 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SmoP56726 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmoP56726 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmoP56726 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmoP56726 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmoP56726 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmoP56726 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmoP56726 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmoP56726 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmoP56726 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmoP56726 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmoP56726 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmoP56726 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmoP56726 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmoP56726 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SmoP56726 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmoP56726 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmoP56726 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmoP56726 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmoP56726 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmoP56726 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmoP56726 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmoP56726 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmoP56726 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmoP56726 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmoP56726 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmoP56726 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmoP56726 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmoP56726 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmoP56726 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmoP56726 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmoP56726 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmoP56726 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmoP56726 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmoP56726 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmoP56726 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmoP56726 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmoP56726 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SmoP56726 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmoP56726 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmoP56726 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmoP56726 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmoP56726 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmoP56726 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmoP56726 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmoP56726 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmoP56726 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmoP56726 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmoP56726 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmoP56726 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmoP56726 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmoP56726 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmoP56726 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmoP56726 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmoP56726 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmoP56726 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmoP56726 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SmoP56726 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SmoP56726 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmoP56726 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmoP56726 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmoP56726 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmoP56726 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SmoP56726 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SmoP56726 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmoP56726 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SmoP56726 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmoP56726 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmoP56726 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmoP56726 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmoP56726 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmoP56726 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmoP56726 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmoP56726 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmoP56726 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmoP56726 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SmoP56726 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmoP56726 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmoP56726 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmoP56726 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmoP56726 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmoP56726 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmoP56726 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmoP56726 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmoP56726 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmoP56726 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmoP56726 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmoP56726 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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