Protein–RNA interactions for Protein: P56393

Cox7b, Cytochrome c oxidase subunit 7B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox7bP56393 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cox7bP56393 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms