Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ephb3P54754 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms