Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms