Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1cP52432 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1cP52432 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1cP52432 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1cP52432 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1cP52432 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1cP52432 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1cP52432 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1cP52432 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1cP52432 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1cP52432 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1cP52432 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1cP52432 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1cP52432 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1cP52432 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1cP52432 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1cP52432 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1cP52432 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1cP52432 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1cP52432 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1cP52432 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1cP52432 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1cP52432 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1cP52432 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Polr1cP52432 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Polr1cP52432 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Polr1cP52432 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1cP52432 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1cP52432 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Polr1cP52432 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1cP52432 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Polr1cP52432 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Polr1cP52432 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Polr1cP52432 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1cP52432 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1cP52432 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1cP52432 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1cP52432 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Polr1cP52432 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Polr1cP52432 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Polr1cP52432 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Polr1cP52432 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Polr1cP52432 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1cP52432 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Polr1cP52432 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1cP52432 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1cP52432 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Polr1cP52432 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1cP52432 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1cP52432 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Polr1cP52432 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1cP52432 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1cP52432 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1cP52432 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1cP52432 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1cP52432 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1cP52432 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1cP52432 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1cP52432 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1cP52432 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1cP52432 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1cP52432 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1cP52432 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1cP52432 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1cP52432 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1cP52432 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1cP52432 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1cP52432 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1cP52432 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1cP52432 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1cP52432 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1cP52432 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1cP52432 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1cP52432 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms