Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClgnP52194 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClgnP52194 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms