Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms