Protein–RNA interactions for Protein: P51906

Slc1a1, Excitatory amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a1P51906 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc1a1P51906 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc1a1P51906 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc1a1P51906 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc1a1P51906 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc1a1P51906 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc1a1P51906 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc1a1P51906 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc1a1P51906 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc1a1P51906 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc1a1P51906 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc1a1P51906 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc1a1P51906 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc1a1P51906 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc1a1P51906 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc1a1P51906 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc1a1P51906 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a1P51906 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a1P51906 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a1P51906 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a1P51906 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a1P51906 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a1P51906 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a1P51906 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a1P51906 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a1P51906 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a1P51906 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a1P51906 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a1P51906 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a1P51906 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a1P51906 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a1P51906 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a1P51906 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a1P51906 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a1P51906 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a1P51906 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a1P51906 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a1P51906 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a1P51906 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a1P51906 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms