Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gpc4P51655 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc4P51655 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc4P51655 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc4P51655 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc4P51655 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc4P51655 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc4P51655 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc4P51655 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc4P51655 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gpc4P51655 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc4P51655 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc4P51655 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gpc4P51655 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc4P51655 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc4P51655 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc4P51655 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc4P51655 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc4P51655 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc4P51655 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc4P51655 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gpc4P51655 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc4P51655 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc4P51655 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc4P51655 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc4P51655 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc4P51655 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc4P51655 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc4P51655 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc4P51655 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc4P51655 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc4P51655 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc4P51655 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc4P51655 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc4P51655 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc4P51655 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc4P51655 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc4P51655 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gpc4P51655 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc4P51655 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc4P51655 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gpc4P51655 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc4P51655 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc4P51655 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc4P51655 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc4P51655 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc4P51655 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc4P51655 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc4P51655 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc4P51655 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc4P51655 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc4P51655 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc4P51655 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc4P51655 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc4P51655 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc4P51655 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc4P51655 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc4P51655 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gpc4P51655 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc4P51655 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc4P51655 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc4P51655 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms