Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa6P50704 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms