Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc13P50207 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms