Protein–RNA interactions for Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp9P49962 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp9P49962 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp9P49962 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp9P49962 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Srp9P49962 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Srp9P49962 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp9P49962 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp9P49962 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp9P49962 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp9P49962 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp9P49962 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp9P49962 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp9P49962 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp9P49962 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp9P49962 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp9P49962 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp9P49962 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp9P49962 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp9P49962 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp9P49962 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp9P49962 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp9P49962 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp9P49962 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp9P49962 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp9P49962 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp9P49962 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp9P49962 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp9P49962 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp9P49962 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp9P49962 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp9P49962 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp9P49962 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp9P49962 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp9P49962 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp9P49962 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp9P49962 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp9P49962 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp9P49962 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp9P49962 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp9P49962 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp9P49962 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp9P49962 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp9P49962 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp9P49962 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp9P49962 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp9P49962 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp9P49962 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp9P49962 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Srp9P49962 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms