Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms