Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcls1P49710 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms