Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CitP49025 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CitP49025 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CitP49025 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CitP49025 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CitP49025 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CitP49025 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CitP49025 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CitP49025 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CitP49025 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CitP49025 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CitP49025 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CitP49025 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CitP49025 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CitP49025 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CitP49025 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CitP49025 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CitP49025 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CitP49025 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CitP49025 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CitP49025 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CitP49025 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CitP49025 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CitP49025 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CitP49025 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CitP49025 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CitP49025 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CitP49025 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CitP49025 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CitP49025 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CitP49025 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CitP49025 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CitP49025 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CitP49025 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CitP49025 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CitP49025 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CitP49025 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CitP49025 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CitP49025 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CitP49025 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CitP49025 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CitP49025 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CitP49025 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CitP49025 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CitP49025 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CitP49025 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CitP49025 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CitP49025 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CitP49025 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CitP49025 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CitP49025 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CitP49025 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CitP49025 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CitP49025 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CitP49025 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CitP49025 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CitP49025 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CitP49025 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CitP49025 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CitP49025 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CitP49025 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CitP49025 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CitP49025 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CitP49025 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CitP49025 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CitP49025 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CitP49025 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CitP49025 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CitP49025 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CitP49025 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CitP49025 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CitP49025 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CitP49025 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CitP49025 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CitP49025 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CitP49025 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CitP49025 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CitP49025 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CitP49025 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CitP49025 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CitP49025 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CitP49025 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CitP49025 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CitP49025 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CitP49025 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CitP49025 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CitP49025 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CitP49025 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CitP49025 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CitP49025 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CitP49025 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CitP49025 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CitP49025 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CitP49025 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CitP49025 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CitP49025 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CitP49025 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CitP49025 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CitP49025 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CitP49025 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms