Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms