Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gli1P47806 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gli1P47806 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gli1P47806 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gli1P47806 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gli1P47806 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gli1P47806 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gli1P47806 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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