Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtgfrP43117 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtgfrP43117 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms