Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdf5P43027 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms