Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NodalP43021 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NodalP43021 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NodalP43021 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NodalP43021 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NodalP43021 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NodalP43021 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NodalP43021 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NodalP43021 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NodalP43021 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NodalP43021 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NodalP43021 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NodalP43021 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NodalP43021 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NodalP43021 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NodalP43021 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NodalP43021 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NodalP43021 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NodalP43021 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NodalP43021 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NodalP43021 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NodalP43021 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NodalP43021 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NodalP43021 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NodalP43021 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NodalP43021 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NodalP43021 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NodalP43021 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NodalP43021 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NodalP43021 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NodalP43021 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NodalP43021 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NodalP43021 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NodalP43021 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NodalP43021 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NodalP43021 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NodalP43021 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NodalP43021 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NodalP43021 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NodalP43021 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NodalP43021 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NodalP43021 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NodalP43021 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NodalP43021 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NodalP43021 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NodalP43021 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NodalP43021 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NodalP43021 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NodalP43021 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NodalP43021 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NodalP43021 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NodalP43021 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NodalP43021 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NodalP43021 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NodalP43021 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NodalP43021 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NodalP43021 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NodalP43021 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NodalP43021 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NodalP43021 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NodalP43021 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NodalP43021 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NodalP43021 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NodalP43021 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NodalP43021 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NodalP43021 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NodalP43021 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NodalP43021 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NodalP43021 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NodalP43021 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NodalP43021 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NodalP43021 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NodalP43021 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NodalP43021 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NodalP43021 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NodalP43021 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NodalP43021 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NodalP43021 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NodalP43021 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NodalP43021 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NodalP43021 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NodalP43021 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NodalP43021 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NodalP43021 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NodalP43021 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NodalP43021 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NodalP43021 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NodalP43021 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NodalP43021 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NodalP43021 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NodalP43021 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NodalP43021 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NodalP43021 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NodalP43021 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NodalP43021 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NodalP43021 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NodalP43021 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NodalP43021 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NodalP43021 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NodalP43021 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms