Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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