Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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