Protein–RNA interactions for Protein: P41241

Csk, Tyrosine-protein kinase CSK, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CskP41241 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CskP41241 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CskP41241 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CskP41241 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CskP41241 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CskP41241 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CskP41241 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CskP41241 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CskP41241 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CskP41241 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CskP41241 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CskP41241 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CskP41241 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CskP41241 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CskP41241 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CskP41241 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CskP41241 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CskP41241 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CskP41241 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CskP41241 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CskP41241 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CskP41241 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CskP41241 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CskP41241 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CskP41241 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CskP41241 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CskP41241 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CskP41241 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CskP41241 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CskP41241 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CskP41241 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CskP41241 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CskP41241 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CskP41241 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CskP41241 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CskP41241 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CskP41241 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CskP41241 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CskP41241 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CskP41241 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CskP41241 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CskP41241 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CskP41241 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CskP41241 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CskP41241 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CskP41241 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CskP41241 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CskP41241 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CskP41241 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CskP41241 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CskP41241 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CskP41241 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CskP41241 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CskP41241 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CskP41241 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CskP41241 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CskP41241 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CskP41241 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CskP41241 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CskP41241 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CskP41241 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CskP41241 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CskP41241 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CskP41241 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CskP41241 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CskP41241 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CskP41241 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CskP41241 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CskP41241 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CskP41241 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CskP41241 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CskP41241 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CskP41241 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CskP41241 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CskP41241 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CskP41241 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CskP41241 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CskP41241 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CskP41241 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CskP41241 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CskP41241 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CskP41241 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CskP41241 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CskP41241 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CskP41241 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CskP41241 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CskP41241 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CskP41241 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CskP41241 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CskP41241 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CskP41241 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CskP41241 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CskP41241 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CskP41241 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CskP41241 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CskP41241 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CskP41241 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CskP41241 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CskP41241 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CskP41241 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms