Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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