Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TtlP38585 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TtlP38585 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TtlP38585 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TtlP38585 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TtlP38585 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TtlP38585 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TtlP38585 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TtlP38585 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TtlP38585 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TtlP38585 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TtlP38585 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TtlP38585 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TtlP38585 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TtlP38585 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TtlP38585 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TtlP38585 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TtlP38585 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TtlP38585 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TtlP38585 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TtlP38585 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TtlP38585 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtlP38585 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtlP38585 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtlP38585 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtlP38585 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtlP38585 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtlP38585 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtlP38585 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtlP38585 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtlP38585 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtlP38585 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtlP38585 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TtlP38585 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtlP38585 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TtlP38585 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtlP38585 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtlP38585 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtlP38585 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TtlP38585 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtlP38585 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtlP38585 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtlP38585 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtlP38585 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtlP38585 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtlP38585 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtlP38585 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtlP38585 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtlP38585 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtlP38585 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtlP38585 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtlP38585 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtlP38585 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtlP38585 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtlP38585 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtlP38585 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtlP38585 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtlP38585 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtlP38585 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtlP38585 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtlP38585 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtlP38585 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtlP38585 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtlP38585 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtlP38585 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtlP38585 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtlP38585 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TtlP38585 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtlP38585 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TtlP38585 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtlP38585 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtlP38585 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TtlP38585 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtlP38585 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtlP38585 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtlP38585 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtlP38585 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtlP38585 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtlP38585 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtlP38585 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtlP38585 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtlP38585 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtlP38585 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtlP38585 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtlP38585 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtlP38585 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtlP38585 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtlP38585 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtlP38585 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtlP38585 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtlP38585 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtlP38585 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtlP38585 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtlP38585 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtlP38585 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtlP38585 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtlP38585 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtlP38585 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtlP38585 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TtlP38585 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms