Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprkP35822 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PtprkP35822 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprkP35822 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprkP35822 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprkP35822 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprkP35822 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprkP35822 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprkP35822 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprkP35822 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprkP35822 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprkP35822 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprkP35822 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms