Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms