Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfc1P35601 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms