Protein–RNA interactions for Protein: P35486

Pdha1, Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdha1P35486 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdha1P35486 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms