Protein–RNA interactions for Protein: P35282

Rab21, Ras-related protein Rab-21, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab21P35282 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab21P35282 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab21P35282 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab21P35282 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab21P35282 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab21P35282 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab21P35282 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab21P35282 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab21P35282 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab21P35282 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab21P35282 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab21P35282 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab21P35282 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rab21P35282 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rab21P35282 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab21P35282 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab21P35282 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab21P35282 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rab21P35282 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab21P35282 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab21P35282 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab21P35282 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab21P35282 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab21P35282 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab21P35282 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab21P35282 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab21P35282 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab21P35282 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab21P35282 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab21P35282 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab21P35282 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab21P35282 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab21P35282 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab21P35282 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rab21P35282 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rab21P35282 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rab21P35282 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab21P35282 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab21P35282 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab21P35282 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab21P35282 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab21P35282 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab21P35282 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab21P35282 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab21P35282 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab21P35282 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab21P35282 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab21P35282 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab21P35282 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab21P35282 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab21P35282 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab21P35282 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab21P35282 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab21P35282 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab21P35282 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab21P35282 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab21P35282 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab21P35282 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab21P35282 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab21P35282 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab21P35282 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab21P35282 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab21P35282 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab21P35282 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rab21P35282 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab21P35282 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab21P35282 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab21P35282 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab21P35282 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab21P35282 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab21P35282 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab21P35282 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab21P35282 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab21P35282 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab21P35282 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab21P35282 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab21P35282 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab21P35282 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab21P35282 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab21P35282 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab21P35282 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab21P35282 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab21P35282 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab21P35282 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab21P35282 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab21P35282 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab21P35282 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab21P35282 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab21P35282 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab21P35282 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab21P35282 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rab21P35282 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab21P35282 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab21P35282 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rab21P35282 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab21P35282 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rab21P35282 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rab21P35282 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab21P35282 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab21P35282 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms