Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptk2P34152 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms