Protein–RNA interactions for Protein: P33610

Prim2, DNA primase large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim2P33610 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim2P33610 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim2P33610 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim2P33610 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim2P33610 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim2P33610 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prim2P33610 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prim2P33610 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prim2P33610 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prim2P33610 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prim2P33610 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prim2P33610 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prim2P33610 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prim2P33610 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prim2P33610 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prim2P33610 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prim2P33610 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prim2P33610 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms