Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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RxrgP28705 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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RxrgP28705 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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RxrgP28705 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RxrgP28705 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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RxrgP28705 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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RxrgP28705 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrgP28705 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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