Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa3P28310 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa3P28310 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms