Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa2P28309 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa2P28309 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa2P28309 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa2P28309 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa2P28309 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms